Parece que o prefixo deveria ser, já que o plugin não suporta globs (*):
prefix => "AWSLogs/828557649675/elasticloadbalancing/eu-west-1/"
Exemplo completo:
input {
s3 {
access_key_id => "my_id"
secret_access_key => "my_key"
bucket => "my_bucket"
region => "region"
prefix => "AWSLogs/828557649675/elasticloadbalancing/eu-west-1/"
}
}