Você não pode rebaixar o servidor SBS 2003 e ainda funcionar como um servidor autônomo. Se você fizer o servidor será desligado automaticamente após 60 minutos.
O servidor SBS 2003 deve ser o DC raiz no domínio e manter todas as funções FSMO.
Depois de ter mais de um usuário, o AD facilita o gerenciamento.
Veja o artigo da KB abaixo, para detalhes sobre o que acontece se você rebaixar o servidor SBS 2003.
O Windows 2003 Small Business Server é desligado inesperadamente