O relatório de erros ao qual você vinculou não parece ser um erro relacionado ao tamanho de arquivo de 4 GB +. 429796854 bytes é um pouco tímido de 410Mb, e parece ser um erro de transporte em vez de um erro de rsync. Se
Eu suspeitaria que a conexão de transporte (presumivelmente SSH) tenha caído, talvez devido a um tempo limite de inatividade porque a CPU gastou tanto tempo entre envios porque tinha que fazer algo como checksum em um arquivo muito grande, e essa é a razão que O rsync relata um cano quebrado.
Tenho certeza de que usei o rsync com êxito em arquivos com mais de 4 GB no passado com clientes e servidores de 32 bits, e pelo menos uma vez mais de 4 GB foi transferido, e não apenas para transferência.