No meu caso, o problema foi causado pela exclusão da conexão com alterações de documentos órfãos.
A solução para o OpenSuse Linux:
- Localize o diretório ~ / .mysql / workbench / sql_workspaces / seu nome de conexão .autosave
- Excluir.
Tão simples quanto isso.
No Windows, o diretório acima deve estar localizado em algum lugar no AppData.