Sua única chance, se este sistema for importante o suficiente, é reinstalar apenas para o db:
rpm -Uvh --justdb <package>
Você pode usar o seu /root/install.log e /var/log/yum.log para obter uma lista de RPMs instalados ou, se você tiver um sistema semelhante, poderá obter a lista de RPM a partir daí.
Dito isto, se este sistema puder sofrer paralisações, sugiro que você volte a instalá-lo da melhor maneira. Caso contrário, veja o comentário acima.
Melhor da sorte