Você não deve precisar de nenhum EPEL para instalar o grupo de pacotes "X Window System". ( os repositórios fornecidos a você pelo seu Assinatura Red Hat deve ser suficiente )
Além disso, o erro que você recebe pode ser um erro no cliente, mas também pode indicar que algo está errado no repositório do yum que você está usando: não sei qual software criou o "prod-epel- x86_64-server-6 ", mas pode indicar uma duplicata (ou seja, dois pacotes com o mesmo nome existem no mesmo repo) ou então o pacote foi alterado desde que o repositório foi criado. (talvez os metadados tenham sido gerados antes que o pacote seja completamente atualizado para repo ou algo assim).
De qualquer forma, já que você não deveria precisar deste repo para instalar o grupo de pacotes "X Window System", eu acho que você deveria fazer isso:
yum clean all
yum --disablerepo "prod-epel-86_64-server-6" groupinstall "X Window System" "Desktop" "Fonts"
E, em seguida, faça um exame mais aprofundado sobre o que está acontecendo com o repositório "prod-epel-86_64-server-6". Se estiver sob seu controle, você poderá tentar gerar metadados para ele.