Mantenha-o no mínimo absoluto em que o seu servidor ainda opera, se possível apenas nos repositórios oficiais do CentOS (os, updates, extras, fasttrack).
Estes repos têm a garantia de serem estáveis desde que o sistema operacional seja mantido.
A desvantagem é que esses repositórios oficiais oferecem apenas funcionalidades limitadas e, às vezes, versões muito antigas (o PHP é um problema típico). Isto é muito diferente da enorme seleção de pacotes que os usuários do Debian estão acostumados, mas torna possível oferecer longos ciclos de suporte para esses produtos.
Todos os outros repositórios oferecerão pacotes adicionais e / ou mais recentes que o padrão e são preferidos a usar em vez de compilar você mesmo, mas como são ofertas de terceiros, podem ser descontinuados a qualquer momento ou ser negligenciados (por exemplo, remi é tratado por apenas um cara, chamado Remi ...!), então você precisa ser cuidadoso e observar isso e pode acabar em uma situação infeliz se um repo realmente for descontinuado.