O AD DS é uma função de servidor que pode ser removida como qualquer outra função de servidor. Execute o DCPROMO em ambos os DCs para rebaixá-los. Quando você rebaixar o último DC, certifique-se de selecionar a opção que é o último DC no domínio. Isso reverterá os dois CDs para servidores autônomos.
Você provavelmente precisará revisitar e provavelmente reconfigurar DHCP e DNS para continuar a servir seus clientes de rede.
EDITAR:
Aqui está minha opinião sobre alguns dos problemas que você relacionou em seu comentário:
Zona rDNS ausente: uma zona rDNS não é um requisito para o AD. É uma preferência. Não há nenhuma função do AD que precise ou exija uma zona rDNS. Eu pessoalmente prefiro criar uma zona de rDNS.
Lixeira do AD não ativada: Novamente, essa é uma preferência e não um requisito. Eu prefiro habilitá-lo.
IPv6 ativado: isso é discutível. Não estou convencido de que deva ser desativado. Eu sei que há muita informação na internet a favor e contra, mas eu nunca tive um problema deixando-a ativada e não vi nenhuma informação técnica da MS que recomende desativá-la.
Sem replicação: se os controladores de domínio não estiverem replicando, isso definitivamente é um problema que precisaria ser resolvido se você estivesse deixando o domínio intacto.