Você não pode usar cegamente um arquivo de configuração do Apache 2.2 com o Apache 2.4!
Por exemplo, os nomes dos módulos foram alterados e adicionados / removidos e, por outro, a sintaxe da configuração sofreu algumas alterações (incompatibel).
Consulte a documentação oficial 2.4 .
Note também que você terá que reinstalar / reconstruir todos os módulos de terceiros, já que os módulos do apache devem ser criados para o servidor específico com o qual serão usados (mais notadamente, o mod_php requer um novo pacote). / p>
Sua pergunta específica sobre a diretiva Header:
Loadmodule header_module /path/to/mod_header.so