Todas as ações que você executar na instância consumirão recursos e afetarão o desempenho até certo ponto. Algumas coisas são mais notáveis do que outras.
Em qual modelo de recuperação seu banco de dados está? A tabela em que você está adicionando os dados está em outro banco de dados?
É difícil dizer qual poderia ser o problema subjacente apenas com as informações que você forneceu. Você terá que fazer algum monitoramento em seu servidor para ver exatamente qual poderia ser a causa. Seu servidor pode estar enfileirando solicitações de E / S, você pode estar aumentando seu arquivo de log trans e executando em esperas lá, você pode estar forçando restrições de memória, índices podem estar sendo reconstruídos, todos os tipos de coisas.