Este é, na verdade, um bug conhecido na transmissão: link . Acho que temos que esperar até que eles consertem.
Quando abro uma janela clicando em um ícone na barra de inicialização ou em um ícone na área da bandeja, às vezes a janela não recebe foco e é aberta atrás da janela ativa no momento. Eu quero que ele abra na frente de todas as outras janelas e obtenha foco. Eu acho que deveria ser o comportamento correto.
Isso não acontece sempre e com todos os aplicativos, mas um exemplo em que isso ocorre consistentemente é ativar a transmissão do menu do ícone da bandeja - ela sempre abre atrás da janela atual.
Estou usando o 11.10 com o Unity2D.