Geralmente, um certificado SSL é para um domínio e se vincula a um endereço IP. Para ter certificados SSL independentes para cada site, você precisará adquirir endereços IP adicionais.
No entanto ...
Se os seus sites forem todos subdomínios de um nome de domínio principal, você poderá usar um certificado curinga que cubra * .example.com. Isso se liga a um endereço IP, mas cobrirá por exemplo: site1.example.com, site2.example.com
Se seus outros sites usarem nomes de domínio diferentes, você poderá adquirir um certificado SSL de vários domínios (também conhecido como Certificado UCC ou SAN) que cubra até 100 domínios diferentes. Existem alguns problemas com estes que podem ser importantes, dependendo da sua situação. Os detalhes do certificado listam todos os outros domínios cobertos. Essa informação só é realmente visível se alguém clica no bloqueio no navegador e verifica os detalhes do certificado. Não é possível alterar o certificado após a compra, portanto, se você quiser adicionar ou remover domínios listados no certificado, precisará adquirir um novo (embora isso varie entre os fornecedores de certificado).