Do site do Cygwin:
Como posso criar meu próprio Cygwin portátil em CD?
Embora alguns usuários tenham feito isso com sucesso, por exemplo, o link do XLiveCD da Indiana University, não há uma maneira fácil de fazê-lo. Instruções completas para a construção manual de um Cygwin portável em CD podem ser encontradas na lista de discussão link . (Obrigado a fergus no bonhard dot uklinux dot net para estas instruções.)