Você pode usar o dnscmd para despejar os arquivos de zona no disco (embora eu ache que ele exclua os registros de cola). Aqui está o arquivo de lote que eu executo no nosso DC para fazer o backup de nossas zonas internas:
dnscmd /zoneprint <ZoneName> > C:\path\to\zone\file
<Lather, rinse, repeat>
xcopy /s /e /y c:\DNSBackup \<Backup server>\path\