Para sua pergunta original: se você montar um sistema de arquivos "no topo" do seu diretório de trabalho atual, você não verá o conteúdo dos fs montados, nem poderá salvar o conteúdo para esse fs até que você grave de volta para o diretório pai e, em seguida, insira o fs montado novamente.
Quando você escreve dados, consome espaço em qualquer sistema de arquivos no qual está gravado. No caso do EFS, os dados salvos não afetarão o uso de seus volumes do EBS.