Não há nenhum problema técnico em usar a maior parte do seu armazenamento - você encontra outro problema se usar TODO o seu armazenamento, como se estivesse sem espaço. O desempenho que você ouviu falar é realmente um problema com discos rígidos de discos giratórios.
O problema com o disco giratório é que, à medida que você preenche a unidade, os dados são gravados cada vez mais longe no prato, fazendo com que a cabeça da unidade tenha que se mover para frente e para trás na bandeja para chegar aos dados. Isso irá introduzir um hit de latência de disco.
Dito isto, com SSDs de extremidade inferior, você precisa estar atento porque eles não têm tantos blocos de reserva separados para substituir os que falharam. Portanto, quando eles ficarem sem blocos sobressalentes e não puderem substituí-los, você poderá ter problemas de desempenho e estabilidade como faria com qualquer unidade que tenha um número crescente de setores defeituosos.
Quanto a quanto sair de graça? Eu deixaria o valor normal que você usaria para qualquer outro servidor em seu ambiente, para que você tenha tempo suficiente para reagir aos alertas de pouco espaço e não fique sem espaço.