Pelo que entendi, você não consegue obter todas as entradas. Parece que você está excedendo o limite de administrador.
Se você quiser pesquisar de um usuário não-cn = Directory manager. você precisa adicionar alguns atributos ao usuário como abaixo.
/usr/lib64/mozldap/ldapmodify -D "cn=directory manager" -w secret -p 389 -h server.example.com
dn: uid=test2,ou=People,dc=example,dc=com
changetype: modify
add: nssizelimit
nssizelimit: -1
-
add: nslookthroughlimit
nslookthroughlimit: -1