A resposta curta é "Não" (pelo menos para pesquisas de DNS externas / reguladas) porque o DNS precisa ser executado na porta 53.
Uma coisa que você poderia fazer (dependendo de quão difícil seria) é modificar o arquivo de hosts em alguns PCs para que eles resolvam da maneira que você quer, sem ir ao servidor DNS para uma pesquisa. .
Dito isto ... você mencionou que isso era para uso interno. Então você pode ser capaz de chegar a algumas soluções. Talvez o encaminhamento condicional possa ajudá-lo?