1), a menos que você tenha toneladas de dinheiro e requisitos de alto desempenho, uma VPN IPSec site-to-site é o que o médico receitou. Eu uso o pfsense para esse propósito, mas existem muitas opções.
2) sim, adicione um novo controlador de domínio ao seu domínio existente. Não se esqueça de criar um novo site (especificando as sub-redes corretamente para cada site), para que seus clientes do AD possam localizar mais facilmente o seu DC mais próximo.