Eu diria que você tem um RAID de software usando seu Windows Server, é por isso que você tem duas opções de inicialização, note que geralmente é uma péssima ideia fazer em servidores de produção, eu recomendo que você use um Hardware RAID .
Verifique se o seu RAID está morto antes de remover e editar as entradas de inicialização, você pode fazer isso visitando o console Gerenciamento de Disco do seu servidor Windows, aqui é uma boa explicação sobre o que procurar quando você for lá , se o RAID estiver funcionando, então deixe-o como está, seu problema de inicialização atrasada pode ser causado por outra coisa.
Se um dos discos RAID estiver morto, você precisará usar a ferramenta BCDEdit para remover a referência com falha do Secondary Plex da seguinte forma:
- BCDEdit / enum (para mostrar todos os GUIDs dos seus discos)
- BCDEdit / delete "GUID"
Mais informações podem ser encontradas aqui sobre o comando BCDEdit
Espero que isso ajude.