Você deve usar o programa htpasswd para criar e adicionar usuários ao arquivo .htpasswd, já que as senhas de texto não são suportadas no linux, por exemplo,
htpasswd -c /home/.htpasswd john
New password:
Re-type new password:
Adding password for user john
criará o arquivo e adicionará o usuário john com a senha que você fornecer. Você pode então adicionar outros usuários como este
htpasswd /home/.htpasswd dave
New password:
Re-type new password:
Adding password for user dave