Por padrão, você não poderá executar bind e dnsmasq simultaneamente, porque eles tentarão se ligar à porta 53 e um deles falhará. (É possível executá-los simultaneamente se você configurá-los para vincular a endereços IP diferentes.) Com base no que você deseja realizar, eu usaria pessoalmente o dnsmasq em vez do bind, porque ele é menor e mais simples. A principal diferença é que o dnsmasq não deve ser usado como um servidor de nomes autoritativo, enquanto o bind é.