Isso soa totalmente bizarro. Tem certeza de que você não possui nenhum software "indesejado" ou software que esteja executando uma função "indesejada" na máquina?
As varreduras sequenciais soam como um software mal-intencionado fazendo varreduras de rede ou algum tipo de "gerenciamento" de rede mal orientado executando varreduras. De qualquer maneira, isso não é um comportamento de estoque do Windows Server 2003. Lembro-me de Kyle Brandt descrever os problemas que viu os drivers da Broadcom causando ARPs espúrios, mas se bem me lembro, não havia sequer uma sugestão de varredura seqüencial para esses ARPs. p>
Microsoft Network Monitor 3 ou Process Monitor pode ser capaz de definir o processo na máquina que está realmente gerando o tráfego. Eu gostaria de me inclinar para o Network Monitor primeiro.