A melhor solução que encontrei foi desse link: Removendo mal funcionamento das soluções do Windows SharePoint Services . Eu basicamente não tinha o serviço de Administração do WSS em execução.
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Faça
stsadm -o enumsolutions
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Copie id da retratação SolutionDeploymentJob
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Faça
stsadm -o canceldeployment -id [SolutionDeploymentJob id]
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Inicie o serviço Administração do WSS e altere-o para iniciar automaticamente
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Executar
stsadm -o execadmsvcjobs
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Retrair e remover a solução da Central Admin como pretendia fazer antes