Você nunca deve acessar seu svn repo diretamente, independentemente de seu sistema de arquivos. Há muito pouco uso que você possa fazer de qualquer maneira.
Você só deve acessá-lo através de seus protocolos, svn: // ou http (s)
É uma boa idéia acessar um repositório SVN via Samba?
Li sobre problemas quando alguém faz isso via NFS - é o mesmo para o Samba?