Você está protegido contra falhas de disco, etc., pela Amazon.
Mas você não está protegido contra falhas do seu próprio código e. g. sobrescrevendo dados por engano. Por isso, sempre tenha um backup externo ou, pelo menos, armazene os dados em dois "buckets" diferentes.
do i have to backup a s3 or ebs service aswell?
... então a resposta é: sim; -)