@ h0tw1r3 tem razão, mas há um erro de digitação, a chave de registro é "SkipEnumerations" (com um 's').
Você pode adicionar isso como um arquivo .reg e importá-lo, mas precisa ativar uma entrada separada para cada porta:
Windows Registry Editor Version 5.00
# Disables automatic mouse detection on boot-up on COM1
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Enum\ACPI\PNP0501\Device Parameters]
"SkipEnumerations"=dword:ffffffff
#if you have more than one hard serial port, enable the following lines as needed for each additional serial port
# for which you want to disable automatic mouse detection on boot-up
#[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Enum\ACPI\PNP0501\Device Parameters]
#"SkipEnumerations"=dword:ffffffff
#
#[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Enum\ACPI\PNP0501\Device Parameters]
#"SkipEnumerations"=dword:ffffffff
#
#[HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Enum\ACPI\PNP0501\Device Parameters]
#"SkipEnumerations"=dword:ffffffff
#
ref: link
É claro que você modifica o registro por sua conta e risco!