Se o SVN não oferecer suporte a links simbólicos, ele não oferecerá suporte à Deduplicação de dados do Servidor 2012, já que é assim o recurso funciona - arquivos "otimizados" são substituídos por "pontos de nova análise", que são pontos de junção para os blocos de dados necessários para reconstituir o arquivo.
Os links simbólicos são uma parte inerente e integral da Desduplicação de Dados do Server 2012, e não há como evitar isso. Não o que você quer ouvir, tenho certeza, mas esse é o longo e o curto dele. O suporte ao Symlink é um pré-requisito necessário para suportar a Desduplicação de Dados do Server 2012.