Você usaria netdom
. Supondo que você não queira se entregar ao túnel do carpo ... e ao dia mais chato de todos os tempos.
Se você tivesse um arquivo de texto com todos os nomes de computador, (um por linha), você poderia criar um script em lote como o abaixo para fazer tudo de uma vez.
FOR /f %%i in (C:\mylistofcomputers.txt) DO (netdom join /d:mydomain.tld /OU:OU=whateverOUtheygoin,DC=mydomain,dC=tld)
Obviamente, execute seu script em lote a partir de uma linha de comando elevada, como um administrador de domínio. Isso deve lhe dar a ideia geral e lhe dar o suficiente para criar um para o seu ambiente.