Eu esperaria que o comando deixasse você com uma única pasta em / home (a última na ordem do dicionário) com todas as outras pastas que estavam sob / home (e ncdu) diretamente abaixo dela. Ah - foi o que aconteceu - virtfs é a última pasta.
Tente ir para / home / virtfs e apenas mv as pastas de volta ao local original.
Comandos sugeridos abaixo. Você vai querer escolher quais pastas mover, em vez de apenas usar *, já que não quer mover as coisas que estavam originalmente em / home / virtfs.
cd /home/virtfs
mv a b c d ..
O mesmo vale para / var. Apenas mude para / var / yp e mv as coisas que acabaram voltando para um nível.