Se você estiver usando a Replicação DFS, conforme indicado nos comentários, não terá uma topologia de replicação de malha configurada, terá um hub e falará com seu servidor "principal" como o hub e todos os seus outros servidores da web são os spokes com replicação unidirecional configurada de hub para spoke. A maneira mais fácil de resolver esse problema é fazer a malha bidirecional de replicação (ou, no mínimo, um hub-and-spoke bidirecional) para que não importe em qual servidor você faça uma alteração. Uma topologia de malha é mais tolerante a falhas do que um hub e fala com 3 ou mais servidores.
A outra alternativa é configurar o Visual Studio para se conectar diretamente ao servidor "principal", em vez de usar o nome do farm da Web. O nome do farm da Web provavelmente é um nome virtual em um nome de DNS do balanceador de carga ou round-robin. Tire isso da equação e conecte-se diretamente ao servidor que você designou como "primário" no farm.