Você usa uma restauração autoritativa quando está restaurando objetos no AD para um estado anterior. Ou seja, restaurar um grupo ao estado anterior se alguém acidentalmente excluísse todos os membros.
Você usa uma restauração não autoritativa quando não deseja que o banco de dados do AD que você está restaurando replique a saída. Como o NTDS.DIT (o banco de dados do AD) é restaurado como parte do estado do sistema, se você precisar restaurar o estado do sistema em um DC, mas não precisar restaurar nada no AD, você faria uma restauração não autoritativa.