Em Como trabalhar com discos básicos e dinâmicos :
- Você não pode converter unidades que usam tamanhos de setor maiores que 512 bytes. Se a unidade tiver tamanhos de setor grandes, você precisará reformatar antes de converter.
- Você não pode usar discos dinâmicos em computadores portáteis ou com mídia removível. Você só pode configurar essas unidades como unidades básicas com partições primárias.
- Você não pode converter um disco se o sistema ou a partição de inicialização fizer parte de um volume estendido, distribuído, espelhado ou RAID-5. Você precisará interromper a abrangência, o espelhamento ou a distribuição antes de converter.
- Você não deve converter um disco se ele contiver várias instalações do sistema operacional Windows. Se fizer isso, você poderá iniciar o computador usando apenas o Windows Server 2008.
- Você pode converter discos em outros tipos de partições que fazem parte de volumes estendidos, distribuídos, espelhados ou RAID-5. Esses volumes se tornam volumes dinâmicos do mesmo tipo. No entanto, você deve converter todas as unidades no conjunto.
Talvez o ponto 1, em particular, seja um que você deva verificar? Adicionalmente, o ponto 3 pode ser relevante (não tenho certeza se isso se aplica somente a software ou hardware e software)