O IPv6 tem um suporte mais explícito para a migração de endereços IP. Alterar sua sub-rede anunciada deve ser transparente para seus usuários. Quando um novo endereço estiver disponível, novas conexões usarão esse novo endereço IP. Conexões antigas ainda usarão o endereço antigo. Eventualmente, o endereço deve ser removido, mas não antes que todas as conexões antigas parem de usar o endereço.
Você pode precisar se certificar de que nenhuma conexão esteja escutando no endereço IP antigo (o netstat é seu amigo aqui).
Em qualquer caso, desde que o endereço antigo não esteja causando nenhum dano, isso não deve ser um problema. Qual é a métrica para este endereço? Está sendo usado para novas conexões?