Se o seu índice é único, diga ao SQL que é único. O otimizador pode usar as informações adicionais, não há desvantagem em fazer isso.
Dito isso, você realmente precisa de um segundo índice? A ordem diferente das chaves para algumas outras consultas é usada? Se não, por que não apenas adicionar as colunas de inclusão adicionais ao primeiro índice, provavelmente será mais barato a longo prazo.