pode ser que o cache de gravação foi desativado? talvez a bateria tenha morrido e tenha mudado de write-back para write-through?
alguns ataques baratos de hardware sem bateria e com cache por padrão ativam o cache apenas para leituras - pode ser que você o configure para usar também o cache de gravação e o controlador "perdeu" as configurações?
além disso - talvez uma das unidades esteja com defeito? tente procurar em logs de raids [a ferramenta de linha de comando MegaCli deve ajudar].