Acabei de descobrir que é possível obter o flash 10.2 (com alguns tweeks) para trabalhar no Ubuntu com aceleração total de hardware. Isso significa que a aceleração de hardware é totalmente suportada no flash 10.03 no Ubuntu sem tweeks manuais?
Phoronix tem um artigo no Flash 10.3 - em resumo, o Flash ainda não tem aceleração de hardware, exceto pelas placas NVIDIA mais recentes.
Veja wikipedia para detalhes sobre o suporte do vdpau em placas nvidia.
Veja também este artigo Phoronix para suporte a vdpau em netbooks.
No entanto, a próxima versão (10.4) deve ser mais interessante para aqueles que usam a ATI ou a Intel, já que a Adobe deve começar a oferecer suporte a eles por meio da interface do VA-API.
Não sei com que tipo de ajustes você está falando, considerando que o Flash não é de código aberto. É necessário editar o /etc/adobe/mms.cfg para ativar a aceleração. A aceleração de hardware do plug-in flash 10.2 depende do site que suporta a API do Stage Video. Atualmente o Youtube faz; Não tenho certeza quantos outros. O outro problema é que ativar a aceleração faz com que muitos sites sejam interrompidos. Eu espero que as coisas melhorem, mas enquanto isso eu ainda estou abrindo o flash-video no Smplayer.