Ter partição separada pode ajudar se você usar uma configuração de sistema de arquivos / montagem diferente para uma partição diferente com base no uso. Alguns sistemas de arquivos são otimizados para SSDs como o NILFS. Então, sim, eles importam. Se você tem RAM suficiente, você pode montar o / var / log no tmpfs para reduzir a pressão no SSD. Opções como noatime certamente podem ser usadas para reduzir as atualizações de disco. Se você não tiver RAM suficiente, ainda poderá montá-lo e usar o SSD para o dispositivo de troca também. Também foi strongmente sugerido usar o escalonador noop I / O ao invés do CFQ padrão no linux. Isso certamente deve reduzir o uso da CPU.
Certifique-se também de usar o linux 2.6.33, se possível, pois ele suporta o ATA Trim, que deve melhorar significativamente a vida útil do dispositivo. Se 2.6.33 não estiver disponível, então você pode olhar para backporting deles.
EDIT: Desde que você mencionou incorporado, presumo que a memória será escassa para tmpfs. Então, nessa situação eu sugiro usar a partição swap no SSD ou se isso também não for possível, um arquivo de troca (como armazenamento de apoio) também fará.