Não há como alterar um domínio do Windows AD quando ele estiver configurado, mas você deve estar usando um subdomínio, por exemplo, ad.example.com , então você tem o básico correto. Se você tivesse usado example.com como um domínio do AD diretamente, teria o problema de manter dois conjuntos diferentes de servidores de nomes para o mesmo domínio: interna e externamente.
Agora, basta delegar o controle de seu subdomínio ad.example.com aos seus controladores de domínio e permitir que os servidores de nomes externos de example.com manipulem seu www.example.com . Ou, se você realmente deseja ter registros separados internamente, você pode adicionar outra zona para example.com em seus servidores de nomes internos.