O Atomic permaneceu nessas versões por várias razões (principalmente estabilidade e suporte), o que foi falado em sua lista de discussão.
Para atualizar esses componentes, você precisará compilar seu próprio rpm-ostree. A Atomic recentemente recebeu suporte para pacotes de sobreposição na instalação, mas ainda está nos estágios iniciais.
Para compilar seu próprio rpm-ostree, você pode começar com a documentação aqui e sua postagem no blog aqui .
Se o seu objetivo for um servidor sem monitoração com o mínimo espaço de ocupação, também recomendamos que você consulte o CoreOS . Sua versão alpha mais recente inclui o docker 1.12.1 e o kubelet 1.3.5 no momento da gravação deste documento.