Não há nada diferente introduzido pela Debian: instale o extlinux como de costume com:
extlinux --install /boot/extlinux
verifique se a imagem do kernel está presente com o initrd correspondente;
crie um arquivo /boot/extlinux/extlinux.conf como:
default linux
timeout 1
label linux
linux ../vmlinuz-4.4.0
append initrd=../initrd.img-4.4.0 root=/dev/vda1 console=tty0 console=ttyS0,115200 ro quiet
label linux-stock
kernel ../vmlinuz-3.16.0-4-amd64
append initrd=../initrd.img-3.16.0-4-amd64 root=/dev/vda1 console=tty0 console=ttyS0,115200 ro quiet
observe que o caminho está em uma caixa na qual / boot não é uma partição própria (faz parte da / partition).
Se a imagem do kernel for muito grande, use a palavra-chave linux (não kernel).