Em caso de dúvida, use o PowerShell . Na verdade, provavelmente é melhor usar apenas o PowerShell por padrão. Na pior das hipóteses, você deve receber uma mensagem de erro para indicar porque você não pode usar o MBR com este disco.
Para inicializar um disco como MBR, use o parâmetro –PartitionStyle. Por exemplo:
Initialize-Disk 4 –PartitionStyle MBR