link sugere que, se o backup for chamado pela interface do usuário, ele solicitará mídia como você esperaria, mas, se for invocada por meio da linha de comando (como faria um arquivo de lote ou uma tarefa agendada), não será.
Naturalmente, essa KB é para WinXP e você especifica Win2003, mas, na minha experiência, se aplicada ao XP, ela se aplica a 2003.
Você deve procurar soluções de backup alternativas; Agora você está enviando dados suficientes para justificar algo um pouco mais confiável do que o NTBackup. Veja se você pode usar o novo requisito para obter algum orçamento para alguns softwares dedicados (por exemplo, Backup Exec, Arcserve) e talvez até mesmo um carregador automático de entrada (por exemplo, um HP MSL 1/8) - você provavelmente não deseja ter que se preocupar em alterar as fitas no meio do backup (especialmente se elas forem executadas durante a noite).
Alternativamente, talvez gastar esse orçamento em um cartão I / O rápido com uma porta externa (por exemplo, USB3 ou Firewire - eu diria eSATA, mas eu não acho que você pode fazer hot-swap estes) para o seu servidor e um punhado de discos externos correspondentes de 2TB e indo para uma solução baseada em disco. Você provavelmente poderia continuar a aproveitar o NTBackup para esses discos (bem como outras ferramentas de backup específicas) e pode até ter espaço suficiente para poder manter mais de um backup por vez neles.