Eu não acho que o MS tenha uma prática recomendada para isso. Depende de você, mas algumas coisas aqui.
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Você deve considerar ter mais de um CD. Coloque outro em execução em um servidor separado (ou host Hyper-V)
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Colocar o host hyper-v no domínio permitirá que você o gerencie com credenciais de domínio, ele permitirá o clustering de failover (não é realmente necessário em seu ambiente, mas ainda assim).
Os problemas aos quais você está se referindo durante a inicialização podem ser resolvidos fazendo o # 1 acima.