Você pode usar o utilitário jar que vem com o java.
cd na pasta webapp e execute o seguinte:
jar cvf ../mywebapp.war *
Problema: Eu tenho um webapp funcionando em um servidor de teste do FreeBSD 8.1 Tomcat 6 que eu preciso migrar para um sistema de produção. O desenvolvedor que o tocou pela última vez (e tinha root nesse servidor) foi movido e não é útil. O aplicativo em execução parece ter sido implantado a partir de um servidor CVS que agora está indisponível.
Meu pensamento é que eu gostaria de encontrar uma maneira de colocar a webapp funcionando em um .war adequado para que eu possa implantá-lo em um host primitivo e (após o teste) enviar o sistema existente para um bitbucket muito profundo. Mas eu não estou tendo sorte em encontrar uma maneira de fazer isso.
Eu sou um administrador de sistemas, não um desenvolvedor e não trabalho muito com os sistemas Tomcat, então talvez eu esteja (provavelmente) negligenciando algo incrivelmente simples. Eu entendo que talvez eu consiga simplesmente armar o diretório implantado e descompactá-lo na nova máquina, mas tenho uma sensação incômoda de que há armadilhas nisso.