Quando você realmente não conhece o script, eu recomendaria wget
em seu CRON para acionar o script pelo seu servidor da Web, como faria o navegador.
Dig em wget http://localhost/yourScript.php
(-O e -o pode ser interessante ou não para receber mensagens de erro & co) Quando você precisa de "mais", como um login usando cookies, você pode verificar curl
Quando for usar hack´n´slay como @pQd mencionado e você não puder editar o script 3rdParty, você deve dar uma olhada em "auto_prepend_file" em seu cli.php.ini e considerar iniciar o trabalho usando php -c