Ao criar uma imagem a partir de um instantâneo, certifique-se de usar a mesma arquitetura usada para a instância / AMI original. O valor padrão neste assistente é i386, mas em muitos casos você pode querer x86_64, que é a arquitetura Linux padrão do Amazon EC2. Isso, junto com a seleção do kernel da AKI, funcionou para mim.