Eu fiz o download do pacote mysql-server-5.7
para testar:
$ apt-get download 'mysql-server*'
Get:1 http://mirror.cse.iitk.ac.in/ubuntu xenial-security/main amd64 mysql-server all 5.7.12-0ubuntu1 [10.1 kB]
Get:2 http://mirror.cse.iitk.ac.in/ubuntu xenial-security/main amd64 mysql-server-5.7 amd64 5.7.12-0ubuntu1 [2,584 kB]
Get:3 http://mirror.cse.iitk.ac.in/ubuntu xenial-security/main amd64 mysql-server-core-5.7 amd64 5.7.12-0ubuntu1 [7,503 kB]
Fetched 10.1 MB in 0s (63.8 MB/s)
$ dpkg-deb --fsys-tarfile mysql-server-5.7_5.7.12-0ubuntu1_amd64.deb| tar x ./etc/mysql
$ grep -e table_cache -e log_slow_queries -e log-queries-not-using-indexes ./etc/mysql/mysql.conf.d/mysqld.cnf
#table_cache = 64
#log_slow_queries = /var/log/mysql/mysql-slow.log
#log-queries-not-using-indexes
Todas as três linhas foram comentadas. Não tenho certeza se uma frase comentada é um grande negócio. O mantenedor do pacote provavelmente os ignora.