Nos fóruns de desenvolvedores da AWS, afirma-se que:
"Linux instances will not report the proper values for CPU usage due to how it communicates on with the virtualization layer on the underlying host. For accurate values for CPU usage on EC2 instances, please use the CloudWatch metrics."
Link: link
Pergunta semelhante aqui no SF: Munin: Gráfico não representando um rótulo