Como os repositórios do Debian (e eu suspeito que todos os apt) usam alguns links simbólicos e sistemas de arquivos do Windows não, aconselho isso devido ao quanto seu repositório pode expandir - embora eu não veja porque não seria possível. Isso pode resultar em um aumento no tamanho do seu espelho de repo em comparação com o espelho upstream porque o symlinking é usado para reduzir duplicatas no espelho.
Eu usaria rsync no windows para criar e manter o espelho. Mais informações estão disponíveis aqui link
Se você estiver pedindo para os usuários incluírem seu repositório em suas fontes, você deve estar ciente das implicações de segurança para o usuário e, talvez, anotar o pinagem como forma de mitigar isso.